由于自閉癥患者的個別差異甚大,加上導致罹患自閉癥的真正機轉至今沒有確切的定論,所以直到目前為止,可以說完全沒有發展出任一套能有效預防自閉癥的方法。
不過,醫界可以認同的是一般性的預防,譬如孕婦應該重視產前檢查,母親在懷孕前應對德國麻疹等已具備免疫能力,在生產的過程應避免腦傷,生產之后也應避免造成腦傷的因素等,如此便可降低出現自閉癥的機會。
再者,對于已經確定為自閉癥的患者,只有藉助認知教學、感覺統合訓練、語言溝通訓練等教育來減輕其殘障的程度。其它尚有音樂治療、藝術治療、游戲治療等方式;但因無法完全獲得治療,所以自閉癥在目前被視為一種終身殘障。